細胞凋亡（apoptosis）一般是指機體細胞在發育過程中或在某些因素作用下，通過細胞內基因及其產物的調控而發生的一種程序性細胞死亡(programmed cell death)。細胞凋亡對胚胎發育及形態發生（morphogenesis）、組織內正常細胞群的穩定、機體的防御和免疫反應、疾病或中毒時引起的細胞損傷、老化、腫瘤的發生進展起著重要作用，并具有潛在的治療意義。

細胞凋亡途徑中各事件的發生是有時序性的，即各事件按先后順序依次發生，最終導致凋亡小體的出現，細胞隨著發生凋亡。 

其典型特征如下： 

早期凋亡：細胞膜結構發生改變，磷脂酰絲氨酸外翻； 

早中期凋亡：細胞質密度增加，線粒體膜電位消失細胞膜，通透性改變，釋放細胞色素C到胞漿中； 

中晚期凋亡：細胞凋亡信號轉導； 

晚期凋亡：DNA降解為180~200bp片段大小。

凋亡早期：Annexin-V/PI雙染色法（PS在細胞外膜上的檢測） 

在正常的活細胞中，磷脂酰絲氨酸（phosphotidylserine，PS）位于細胞膜的內側，細胞發生凋亡時，細胞膜發生變化，PS 從細胞膜的內表面翻轉到細胞膜的外表面。Annexin-V（膜聯蛋白-V）是一種分子量為35-36 KD的Ca2+依賴性磷脂結合蛋白，能與PS高親和力結合。用熒光素（FITC、Alexa Fluor488等）標記的Annexin-V作為探針，利用流式細胞儀或熒光顯微鏡即可鑒別凋亡細胞和活細胞。 

壞死的細胞PS同樣也會從細胞膜的內表面翻轉到細胞膜的外表面，Annexin-V也能識別壞死細胞表面的PS,所以Annexin-V 無法區分壞死細胞和凋亡細胞。另外碘化丙啶(propidine iodide, PI)是一種核酸染料，能夠與細胞內DNA結合，而且它不能透過完整的細胞膜。早期凋亡細胞和活細胞的細胞膜仍然完整，PI染料無法自由通過細胞膜進入細胞內與DNA結合，所以PI 染料無法標記凋亡細胞和活細胞，而PI染料卻能夠通過壞死細胞的細胞膜與細胞內的DNA結合，壞死細胞內的PI染料被488nm激光激發后會發射紅熒光，被相應通道接收。所以Annexin V和PI同時使用，就可以區分活細胞、早期凋亡細胞和壞死細胞。

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